JWS signaleert actief misstanden in de zorg en verzamelt getuigenissen van medische professionals. Waar nodig kaart zij deze aan bij beleidsmakers of de media.
JWS bevordert de kennis en deskundigheid op het terrein van de mensenrechten en gezondheidszorg door het verstrekken van onafhankelijke voorlichting en informatie op dit gebied aan artsen, verpleegkundigen en andere (toekomstige) professionals in de zorg en het sociale domein.
Voor de voorlichting en educatie op het terrein van de gezondheidszorg en mensenrechten ontwikkelt JWS ook e-learnings.
Daarnaast organiseert de stichting symposia en webinars over actuele kwesties en dilemma’s, zoals de zorg aan ouderen of vluchtelingen en over gezondheidsverschillen of het medisch beroepsgeheim.
JWS heeft wisselende lopende projecten op het terrein van mensenrechten en gezondheidszorg zoals het project Taalbarrières in de zorg en het sociale domein. De uitvoering van deze projecten is belegd bij werkgroepen.
Ook draagt JWS bij aan zogenaamde schaduwrapportages, waarbij de stichting zich beperkt tot die onderwerpen die tot haar missie kunnen worden gerekend. Per rapportage worden relevante samenwerkingspartners gevraagd om eventuele inbreng bij een rapportage. De concluding observations van toezichthoudende comités van de Verenigde Naties over rapportages waaraan JWS een bijdrage heeft geleverd worden onder betrokken beroepsgroepen verspreid en eventueel van commentaar voorzien.
De Johannes Wier Stichting brengt ten behoeve van haar donateurs circa 6 keer per jaar een e-zine uit waar verschillende artikelen met betrekking tot de activiteiten van de Johannes Wier Stichting in worden gepubliceerd.
Het bestuur stelt elk jaar een werkplan op met voorgenomen activiteiten.